计算机网络笔记第二章-物理层
物理层 1、物理层的基本概念物理层：怎样才能在连接各种计算机的传输媒体上传输数据比特流，而不是指具体的传输媒体，尽可能地屏蔽掉不同传输媒体和通信手段的差异 物理层的协议：物理层规程 (procedure) 主要任务：确定与传输媒体的接口的一些特性 机械特性 ：指明接口所用接线器的形状和尺寸、引线数目和排列、固定和锁定装置等。 电气特性：指明在接口电缆的各条线上出现的电压的范围。 功能特性：指明某
计算机网络-第一章概述
概述1.1计算机网络的定义及其特点 网络：是一个统称，泛指把人或物互连在一起而形成的系统。 三大类网络:电信网络、有线电视网络、计算机网络 计算机网络的定义:计算机网络主要是由一些通用的、可编程的硬件互连而成的，而这些硬件并非专门用来实现某一特定目的（例如，传送数据或视频信号）。 计算机网络的特点：连通性、共享（资源共享） 1.2互联网概述 互联网：特指 Internet，它起源于美国，是由
基于TCGA数据库筛选和肾癌（KIRC亚型）差异基因（实现）
1.数据下载1.1 网页下载 1.2 TCGABiolinks下载setwd("D:\Bioinformatics data analysis") if (!requireNamespace("BiocManager", quietly = TRUE)) install.packages("BiocManager")
TCGA 差异基因分析
TCGA数据库数据库简介肿瘤被认为是人类最复杂疾病之一, 目前为止人类已经发现了超过200种肿瘤亚型。肿瘤病人基因中发生的变化如体细胞突变、拷贝数变异、基因表达量差异和表观修饰变化与其特定的肿瘤亚型是相对应的。 **目的: **为了更好地发现、诊断和治疗肿瘤, 对其基因变化进行深入研究和建立相应数据库是目前所急需的。TCGA计划旨在通过大规模基因测序和综合性、多维度的分析手段来寻找由肿瘤发生发展造
TCGA数据库中含有的癌症名称、简写、中文名称对照表
Cohort 英文名称 中文名称 ACC Adrenocortical carcinoma 肾上腺皮质癌 BLCA Bladder Urothelial Carcinoma 膀胱尿路上皮癌 BRCA Breast invasive carcinoma 乳腺浸润癌 CESC Cervical squamous cell carcinoma and endocervical a
pheatmap 相关性热图 基因表达量热图
作者：APExBIO链接：https://www.jianshu.com/p/9a5f8eef02fb来源：简书著作权归作者所有。商业转载请联系作者获得授权，非商业转载请注明出处。 热图热图概念：热图是一个以颜色变化来显示数据的矩阵，可以简单地聚合大量数据，并使用一种渐进的色带直观地展现空间数据的相对大小。 热图在生物学中的应用：生物学中热图经常用于展示多个基因在不同样本中的表达水平。然后可以
利用R包TCGAbiolinks进行各种数据下载
TCGAbiolinks的优点在于具备一体化的下载整合，无需再使用复杂的方法对下载的单个数据重新进行整合，换句话说，就是TCGAbiolinks包下载的数据是合并了的，不需要整理（TCGAbiolinks数据下载）。TCGAbiolinks的官方网站是：http://www.bioconductor.org/packages/devel/bioc/vignettes/TCGAbiolinks/in
基于TCGA数据库筛选与胃癌预后相关的差异基因
基于TCGA数据库筛选与胃癌预后相关的差异基因田如月 郭水龙 曹邦伟 首都医科大学附属北京友谊医院肿瘤中心 首都医科大学附属北京友谊医院消化内科国家消化系统疾病临床医学研究中心首都医科大学消化病学系 摘 要： 目的: 通过对癌症基因组图谱(TCGA)数据库中胃腺癌转录组数据进行分析，找出预后相关的差异表达基因。 方法 :从TCGA数据库中下载胃腺癌的转录组数据，利用R语言edgeR包筛选出差